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花生PDAT基因家族的全基因組生物信息學(xué)分析

作者:田?,? 單雷; 李新國; 郭峰; 張智猛; 孟靜靜; 萬書波; 彭振英 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院生物技術(shù)研究中心/山東省作物遺傳改良與生態(tài)生理重點實驗室; 山東濟南250100; 山東省花生研究所; 山東青島266100; 山東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院; 山東濟南250100

摘要:磷脂二酰甘油酰基轉(zhuǎn)移酶(phospholipids:diacylglycerol acyltransferase,PDAT)催化磷脂和二酰甘油反應(yīng),生成溶血磷脂和三酰甘油,是植物三酰甘油合成的關(guān)鍵酶之一。為了在全基因組水平上探究花生PDAT(AhPDAT)基因家族的特征,通過生物信息學(xué)方法,結(jié)合花生基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對AhPDAT家族成員從系統(tǒng)進化、基因結(jié)構(gòu)、表達模式以及可變剪接等方面進行系統(tǒng)分析。結(jié)果顯示,AhPDAT家族包含17個成員,不均勻分布于9條染色體上。系統(tǒng)進化分析發(fā)現(xiàn),AhPDATs與大豆、苜蓿以及菜豆聚在一起,親緣關(guān)系較近?;蚪Y(jié)構(gòu)分析顯示,AhPDATs基因具有2~8個外顯子,可編碼88~742個氨基酸。表達模式分析發(fā)現(xiàn),AhPDATs家族成員組織表達多樣化,這種表達模式的差異表明它們功能分工的不同。同時,該家族基因還存在豐富的可變剪接類型。這些結(jié)果為今后進一步開展AhPDATs基因家族的功能研究提供參考,同時也為花生品質(zhì)育種奠定了一定的理論基礎(chǔ)。

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花生學(xué)報雜志

花生學(xué)報雜志, 季刊,本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向,堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:栽培生理、土壤肥料、花生遺傳育種、栽培生理、植物保護、貯藏加工、分析測試、產(chǎn)業(yè)化等。于1972年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。

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