自噬標(biāo)志分子ATG8同源蛋白的生物信息
作者：倪志華; 劉阿顯; 楊會然; 樊瑞陽; 李寶庫 河北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院; 保定071002; 河北大學(xué)藥學(xué)院; 保定071002; 河北省生物工程技術(shù)研究中心; 保定071002
摘要：自噬是細(xì)胞重要的代謝途徑,ATG8在自噬體形成過程中起著重要的作用。對ATG8蛋白進行生物信息學(xué)分析研究十分必要。本研究以NCBI中人ATG8同源蛋白序列數(shù)據(jù)為研究材料,分析其與10種模式生物間基因拷貝數(shù)、氨基酸序列、蛋白質(zhì)保守位點相關(guān)性。結(jié)果表明,人6種ATG8同源蛋白分別定位于5條染色體上,均有泛素樣GABARAP結(jié)構(gòu)域。并且,所有模式生物的ATG8同源蛋白中N-端氨基酸序列保守性強于C-端序列。本研究構(gòu)建的ATG8同源蛋白系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,人的ATG8同源蛋白與脊椎動物(斑馬魚,爪蟾,小鼠,大鼠,牛)的ATG8蛋白親緣關(guān)系更近,人的GABARAPs與酵母的ATG8蛋白與的親緣關(guān)系較近。本研究為研究細(xì)胞自噬過程及機制提供了豐富的生物進化和生物信息數(shù)據(jù)支持。
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基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志
基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué)雜志， 月刊，本刊重視學(xué)術(shù)導(dǎo)向，堅持科學(xué)性、學(xué)術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性，刊載內(nèi)容涉及的欄目：綜述與專論、研究論文、研究報告、實驗技術(shù)。等。于1982年經(jīng)新聞總署批準(zhǔn)的正規(guī)刊物。
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