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基于基因組解析不同香菇菌株木質(zhì)纖維素降解酶體系的差異

作者:楊瑞恒; 李焱; 吳瑩瑩; 唐利華; 尚俊軍; 鮑大鵬 上海市農(nóng)業(yè)科學院食用菌研究所; 農(nóng)業(yè)部南方食用菌資源利用重點實驗室; 國家食用菌工程技術(shù)研究中心; 國家食用菌加工技術(shù)研發(fā)分中心; 上海市農(nóng)業(yè)遺傳育種重點開放實驗室; 上海201403

摘要:通過比較香菇(Lentinula edodes)野生菌株L3,NCBI已公布的菌株135A、135B、B17、NBRC 111202、W1-26,木腐菌金針菇(Flammulina velutipes)、糙皮側(cè)耳(Pleurotus ostreatus),以及草腐菌雙孢蘑菇(Agaricus bisporus)、灰蓋鬼傘(Coprinopsis cinerea)、草菇(Volvariella volvacea)的基因組。結(jié)果表明:香菇不同菌株間基因組存在較大差異,大小為36.69~46.11 Mb,基因數(shù)量為11192~14889;香菇菌株135A、135B、B17、L3、NBRC 111202和W1-26基因組注釋的碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)基因數(shù)量分別為520、520、483、475、524和537,其中L3最少,為475;纖維素酶在香菇不同菌株中基因數(shù)量為19~22,低于灰蓋鬼傘和草菇,高于雙孢蘑菇;不同香菇菌株的氧化還原酶基因數(shù)量為41~55,L3最少,為41,NBRC 111202最多,為55,135A和135B最為接近。在基因水平上,木腐菌與草腐菌的木質(zhì)纖維素降解酶體系沒有完全的界限,它們之間存在一定的共性,因此木腐菌草腐化栽培存在可能性。

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食用菌學報雜志, 雙月刊,本刊重視學術(shù)導向,堅持科學性、學術(shù)性、先進性、創(chuàng)新性,刊載內(nèi)容涉及的欄目:遺傳育種、生理生化、馴化栽培、栽培材料、病蟲害防治、產(chǎn)后加工等。于1994年經(jīng)新聞總署批準的正規(guī)刊物。

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