基于多尺度熵的DNA序列相似性分析
作者：張靜; 周小安; 趙宇 深圳大學(xué)信息工程學(xué)院; 廣東深圳518000
摘要：DNA序列的相似性分析已成為當(dāng)前生物信息學(xué)科中的研究熱點(diǎn),對(duì)分析算法的需求也逐步增加,基于樣本熵的DNA序列相似性分析方法存在一定的效率問題。本文提出了一種基于多尺度熵的分析方法,以7種病毒DNA序列作為實(shí)驗(yàn)研究的對(duì)象,采用整數(shù)法將其分別表示為時(shí)間序列,而后通過對(duì)比多個(gè)時(shí)間尺度下序列之間樣本熵互值大小來顯示序列之間的相關(guān)性,并與原有的樣本熵算法的分析結(jié)果進(jìn)行比較。實(shí)驗(yàn)表明,本文提出多尺度熵分析方法是切實(shí)可行的。
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智能計(jì)算機(jī)與應(yīng)用雜志
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